Mısır'da Hüsnü Mübarek'in devrilmesinden sonra yönetimi devralan Askeri Konsey ve cumhurbaşkanlığı seçimini kazanan Müslüman Kardeşler'in adayı Muhammed Mursi ABD'yi zorda bıraktı. Yeni cumhurbaşkanını tebrik etmek için Kahire'ye giden Dışişleri Bakanı Hillary Clinton, Askeri Konsey Başkanı Hüseyin Tantavi ve Muhammed Mursi ile bir araya geldi. Ancak Askeri Konsey ile Cumhurbaşkanı Mursi arasındaki yetki çekişmesi ABD politikasını da belirsiz hale getirdi. Askeri Konsey'in demokratik yönetime geçerken sivil yönetime destek vermesini isteyen Clinton, Mursi ile de ekonomik ilişkiler hakkında bir görüşme yaptı. Siyasi gözlemciler, ABD'nin Askeri Konsey'i zaman zaman eleştirmesini ve Müslüman Kardeşler'e destek olan açıklamaları politika belirsizliğine örnek olarak gösterdi. Bu arada cumhurbaşkanlığı yarışını az farkla kaybeden eski Başbakan Ahmet Şefik yanlıları Müslüman Kardeşler Teşkilatı ile işbirliği yaptığı gerekçesiyle Clinton'u protesto etti. 
