Birbiri ile karıştırılan canlılar arasında at ve midillinin yer aldığı söylenebilir. Bu kapsamda en çok yanıt aranan soru ise midillinin bir at türü olup olmadığıdır. Midilli ile at arasındaki temel farklılıkların açıklanabilmesi için ise bilimsel adı Equidae olan atgiller ailesinin üyeleri incelenmelidir. Böylelikle at ve midilli arasındaki fark nedir, aynı hayvan mı diyenler için anlaşılır bilgiler derlenebilir.
Bilimsel ismi Equus caballus olan at, Equidae yani atgiller ailesine ait olan bir memeli türüdür. Otobur bir toynaklı memeli türü olarak bilinen atlar temelde yabani ve evcil olmak üzere iki ayrı kategoride ele alınır. Ancak atların iki türünün olduğunun söylenmesi yeterli bir bilgi değildir. Nitekim erkeğine aygır, dişisine kısrak, yavrusuna ise tay denilen atların birden fazla türü mevcuttur. Bu canlıların türlerine yönelik olarak bilgi sunulması ise "Midilli ve at aynı hayvan mı?" sorusunun yanıtlanması için önem arz eden bir noktadır.
Atların Arap, İngiliz, Türk (Rahvan), Ahal Teke ve midilli gibi türleri vardır. Bu açıklamadan da anlaşıldığı üzere midilli bir at türüdür. Dolayısıyla temelde midilli olarak bilinen canlılar da Equidae yani atgiller ailesinin bir üyesidir. Belirli yapılara sahip küçük bir at ırkı olarak tanımlanan midillilerin kendi içinde de farklı türlerinin olduğu bilinir. Midillilerin tür sınıflandırmasına bakıldığında ise bu canlıların genellikle büyük, orta ve küçük ölçülüler olarak nitelendirildiği görülür.
Midilli temelde belirgin yapısal özellikleri ile atlardan ayrılan küçük bir canlı ırkı olarak tanımlanır. Bu canlıların geçmişte farklı habitatlarda yaşadıkları ve zaman içerisinde küçülerek günümüzdeki fiziksel özelliklerine kavuştuğu bilinir. Dolayısıyla midilli olarak adlandırılan bu at ırkının temelde orijinal vahşi atlardan türediği belirtilebilir. Bu küçük at ırkının ait olduğu canlı familyasındaki diğer üyelerden ayrılmasını sağlayan belirgin farklılıklar ise aşağıdaki gibi sıralanabilir: