Yürürlüğe giren 3. yargı paketi ile Özel yetkili mahkemeler kaldırıldı. Yerine Terörle Mücadele Kanunu'nun (TMK) 10. maddesi ile yetkilendirilen Bölge Ağır Ceza Mahkemesi ve 'özgürlük hakimi' sistemi getirildi. Bu yeni düzenleme Çağlayan'da Adalet Sarayı'ndaki Ağır Ceza Mahkemesi'nde krize neden oldu. Nöbetçi özel yetkili İstanbul 12. Ağır Ceza Hakimi Mehmet Hamzaçebi, yeni yasanın yürürlüğe girdiğini belirterek, savcı ve polislerden gelen taleplere imza atmadı. Arama-el koyma, teknik takip kararları gün boyu imza için bekledi. Karar almak üzere Adliye'ye gelen emniyet ve MİT görevlileri saatlerce hakimden bir açıklama bekledi. Bunun üzerine HSYK, hakim Hamzaçebi'ye "Yetkileriniz yeni sistem(özgürlük hakimi) kurulana kadar geçerli. Kararları eskisi gibi imzalayabilirsiniz. Görev yazısını İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı'na yazıyoruz" deyince, taleplere imza atılmaya başlandı.
