Batı ile İslam dünyasının ilişkisini ele alan İzzetbegoviç, bu deklarasyonun ardından "Bölücülük ve İslam devleti kurma" suçlarından beraberindeki 12 Bosnalı aydınla 1983'te 14 yıl hapse mahkûm edildi. 1988'de Yugoslavya hükümetinin "Sözlü muhalefet sebebiyle cezalandırılan mahkûmların serbest bırakılması" kararının ardından hapisten çıktı. Bosna Hersek'in Bosanski Şamats şehrinde 1925'te doğan İzzetbegoviç, İkinci Dünya Savaşı boyunca faşist ideolojiye, sonrasında ise komünist ideolojiye karşı mücadele verdi. Boşnaklar'ı biyolojik ve manevi soykırımdan korumak için kurulan Mladi Müslümani (Genç Müslümanlar) isimli yapıda yer aldı. 27 Mart 1990'da Demokratik Eylem Partisi'ni (SDA) kurup ilk seçimde 240 milletvekilliğinden 86'sını kazandı. Bağımsızlık için referandum düzenleyip yüzde 99.44'lük oranla Bosna'yı özgürleştirdi. Sırplar'la çıkan savaşı yönetti. Srebrenita'da 1995'te soykırım uygulanırken, İzzetbegoviç halkını direnişe çağırdı.1 Kasım 1995'te imzalanan Dayton Antlaşması ile Bosna Hersek'in sınırlarını korumayı başardı. Savaşın yaralarının sarılmasına ve ülkenin kalkınmasına önemli katkılarda bulundu. Rahatsızlığı nedeniyle 2000'de devlet başkanlığı görevinden çekilen İzzetbegoviç, 19 Ekim 2003'te vefat etti.