Birinci Ergenekon davası dosyasına gönderilen bilirkişi raporunda, Danıştay'a silahlı baskın yapıldığı 2006 mayısında, daha önce açıklandığının aksine, güvenlik kameralarının arızalı olmadığı ortaya çıktı. Saldırıdan bir gün önce bir kısım kayıtların silindiği anlaşıldı. Davanın dünkü duruşmasında, son gelen evrakı okuyan hâkim Hasan Hüseyin Özese, daha önce istenen ve 3-17 Mayıs 2006 tarihleri arasında arızalı olduğu bildirilen Danıştay binasının kameralarıyla ilgili bilirkişi raporunun TÜ- BİTAK'tan geldiğini açıkladı. Bilirkişi Dr. Hayrettin Bahşi'nin raporuna göre, güvenlik kameralarına ait harddiskte arıza saptanmadı, görüntülerin bir kısmının silindiği anlaşıldı. "OYAK Savunma ve Güvenlik Şirketi'nin gönderdiği söz konusu harddisk'te herhangi bir arızaya rastlanmamıştır" denildi. Alparslan Arslan'ın saldırıdan bir gün önce Danıştay binasında keşif yaptığı 16 Mayıs 2006 tarihinde, saat 19.47-19.50 arasında, 3 dakika içinde kayıtların silindiği tespit edildi. 16 Mayıs 2006 tarihine ilişkin silinmiş bazı dosyalar bulundu. Bu dosyaların önemli bir kısmının aynı tarihte ve saat 19.47-19.50 arasında geri döndürülemez şekilde silindiği belirlendi. "Söz konusu dosyaların sadece isimlerine erişilmiştir. Harddiskteki bazı dosyaların bir kısmının da isimleri değiştirildikten sonra silindiği saptanmıştır" denildi. Silinen kayıtların bir kısmının özel bir program yardımıyla kurtarıldığı ve görüntülerin mahkemeye gönderildiği kaydedildi. 3- 15 Mayıs arasındaki bazı kayıtların bir kısmının kurtarıldığı da ifade edildi. Kurtarılan ve mahkemeye gönderilen görüntülerde Danıştay sanıkları ve saldırıya ilişkin herhangi bir görüntüye rastlanmadı. Geri döndürülebilen dosyalar içinde Danıştay'daki kamera sisteminin kurulduğu 23 Aralık 2005'ten önceki tarihlerde kayıtların olduğuna dikkat çekildi. Bu durum güvenlik şirketinin gönderdiği harddisk'in daha önce başka yerde de kullanılmış olabileceğini ya da şirketin orijinal harddiski göndermeme ihtimalini ortaya koydu. Kamera görüntülerinin kopyalandığı DVD'deki dosyaların 'az' olduğu kaydedildi. TÜBİTAK raporunda "Bir kamera bir günde 40'a yakın dosya üretmektedir. Firma tarafından teslim edilen DVD'de gün başına her kamerada yer alan dosya sayısı 6'dır. Bu durumda her güne ait dosyaların büyük bölümünün DVD'de yer almadığı sonucuna varılmıştır" denildi. Harddiskin, 16 Mayıs 2006'da Danıştay'dan güvenlik şirketi tarafından geri alındığı belirtildi. Ancak şirketin gönderdiği DVD'de, 22 Mayıs ve 6 Haziran 2006'ya ait kayıtların olduğu belirtildi. Firmanın o tarihte harddiskte bir işlem yapıldığı sonucuna varıldığı ifade edildi. Danıştay binasında 8 kameranın bulunduğu anlatılan rapora göre, 16 Mayıs 2006 tarihli kameralarda herhangi bir görüntü mevcut değil. Raporda, DVD'de olup da harddiskte aynı isimle 'geri döndürülemez' şekilde silinmiş olan bazı dosyalar olduğu belirtilerek, "Bu işlemin bilinçli bir silme olabileceği ve silme tarihlerini de saklamaya yönelik olabileceği değerlendirilmektedir" denildi. Geri döndürülen dosya isimlerinden çıkarılan tarih ve zaman bilgisi ile kamera kaydının gerçek kayıt tarihi ve zaman bilgisinin 'tamamen farklı' olduğu anlatıldı. Silinmemiş olarak bulunan bazı dosyaların, şirket tarafından verilen DVD'de yer almadığı belirtildi. İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi, görüntülerin silinmesinden sorumlu olanlar hakkında suç duyurusunda bulunulmasına karar verdi. Orhan Pamuk'a düzenlenmesi planlanan suikastın tetikçisi olduğu iddiasıyla tutuklu bulunan Selim Akkurt tahliye edildi. Akkurt, başka bir suçtan hükümlü olduğu için cezaevinden çıkamayacak.
