21 Ocak'ta Balyoz Eylem Planı soruşturması başladığında UYAP'ta Özel Yetkili Cumhuriyet Savcısı Bilal Bayraktar adına kaydedilen soruşturma evrakı, daha sonra soruşturmaya 4'üncü savcı olarak görevlendirilen Süleyman Pehlivan ve yeni atanan iki yeni savcıdan Mehmet Ergül adına kaydedildi. Savcılar en kıdemli savcı Mehmet Ergül'ün bilgisi dışında işlem yapamayacak. İstanbul Cumhuriyet Başsavcısı Aykut Cengiz Engin de, iki savcının görevden alınmasının makul sebeplere dayandığını söyledi. Gerekçelerin ne olduğunu açıklamayan Engin, yeni savcıların dosyaları tetkiki için zaman gerektiğini, bu nedenle operasyonlara ara verildiğini kaydetti. İstanbul Başsavcılığı'nın açıklamasında ise şu ifadeler yer aldı: "Medyada başsavcılık tarafından yapılan bu yeni görevlendirmeler nedeniyle, mahkeme kararlarına istinaden yapılan işlemlerin durdurulduğuna ilişkin yorumlar yapılıyor. Mahkeme kararının durdurulması gibi bir husus söz konusu değil. Buradaki işlem, soruşturma savcılarının doğrudan kolluğa ve merkez komutanlıklarına yazdıkları müzakkerelere ilişkindir. Yakalama ve gözaltına alma yazıları herhangi bir mahkeme kararına dayanmamaktadır. Soruşturma da tamamen durdurulmuş değil. Yeni görevlendirilen savcıların bu konuda talimatları beklenecektir.
