Genelkurmay Başkanlığı, Kuzey Irak'a sınır ötesi operasyon yapılmasına izin veren ve 17 Ekim 2009'da sona erecek tezkerenin uzatılması yönünde 14 Eylül'de Başbakanlık'tan talepte bulunulduğunu açıkladı. Genelkurmay'da geçen hafta düzenlenen basın bilgilendirme toplantısında da "Son terörist etkisiz hale getirilene kadar operasyonların süreceği" mesajı verilmişti. Hükümet ise, tezkerenin demokratik açılıma zarar vermesinden endişe ediyor. Genelkurmay'ın haftalık basın toplantısında, tartışılan uzun menzilli hava savunma füze sistemine ilişkin de bilgi verildi. Proje maliyetinin 7.8 milyar dolar olmadığı, 1 milyar dolar olduğu ve bu ödemenin de tek seferde değil, 6 yılda yapılacağı belirtildi. Genelkurmay Adli Müşaviri Tümgeneral Hıfzı Çubuklu Albay Cemal Temizöz'ün yargılandığı davada tanık ifadelerinin geri çekilmesiyle ilgili iddiaları, "yakinen takip ettiklerini" belirterek, Temizöz'ün yargılandığı sırada açığa alınmamasıyla ilgili de şu açıklamayı yaptı: "Gerek tutuklu gerekse hükümlülerin ya da açığa alınanların, 926 sayılı personel kanunu kapsamında atamaya tabi tutulacaklarına ilişkin bir hüküm yoktur. Esas olan personelin bulunduğu görevde, göreve bağlı şekilde göreve devam etmesidir. Ancak o görevi yapmasına engel bir hüküm varsa, soruşturmanın veya yargılamanın selameti açısından bir sıkıntı varsa, bu durumda ataması yapılmaktadır, ya da yer değiştirilmektedir, ya da emre alınmaktadır. Açığa almakla yetkili İçişleri veya MSB veya onların yetki verdiği müsteşarın takdir yetkisine tabidir. Zekeriya Duran ise albay olmuştur. Rütbe terfisine engel bir şey yoktur. Terfi şartları TSK Personel Kanunu'nda belirtilmiştir. Bunlara engel bir hüküm olmadıktan sonra rütbe terfisine engel olamıyoruz."