İstanbul Emniyet Müdürlüğü'nde 17-25 Aralık süreci kapsamında yürütülen soruşturma, Kaçakçılık ve Organize Suçlarla Mücadele (KOM) Daire Başkanlığı'na sıçradı. Bilgisayarlarından ülke genelindeki tüm KOM şubelerinin hareketlerini görebilen KOM Daire Başkanlığı'nda, çok sayıda görevli hakkında usulsüz işlem yürütüp sürece müdahale etmedikleri ve denetleme görevini yerine getirmedikleri gerekçesiyle soruşturma başlatıldı. Daha önce KOM Daire Başkanı Mehmet Yeşilkaya görevden alınmış ve yerine Hacı Yusuf Karababa getirilmişti. Ayrıca İstanbul Emniyet Müdürlüğü'nde "izinsiz dinleme", "yasadışı arşiv oluşturma" ve "operasyonel bilgisi silme ve izinsiz olarak kurum dışına çıkarma" iddialarıyla 30'a yakın polis açığa alınmıştı.
