Bu seçimler Ahmedinecad ve Musavi arasında kıyasaya yarış olarak görülse de, aslında arka planda iki dini lider yarışıyor. Ayetullah Ali Hamaney, Ahmedinecad'ı destekliyor. İran Uzmanlar Meclisi ve Düzenin Yararını Teşhis Konseyi Başkanı Haşimi Rafsancani ise Musavi'ye destek veriyor. Ahmedinecad'ın Rafsancani'yi yolsuzlukla suçlaması üzerine, bu iki lider arasındaki çekişme iyice su yüzüne çıktı. Rafsancani, Ahmedinecad'ın saldırıları üzerine Hameney'i başkanlık seçimlerinin şeffaflık içinde gerçekleşmesi için müdahaleye çağırdı.