Genelkurmay Başkanı Orgeneral İlker Başbuğ'un belge olayı ile ilgili olarak karargâh personeline "kesinlikle konuşmayın" emri verdiği öğrenildi. Genelkurmay Başkanlığı, Başbuğ'un emri üzerine, Askeri Savcılığın konuyla ilgili soruşturması bitene kadar hiçbir açıklama yapmayacak. Genelkurmay ayrı doküman ve bilgi sızmalarına karşı olağanüstü önlemler aldı. Bilgisayar çıktıları ve gizli belgelerin her biri özel olarak numaralandırdı, tüm bilgisayarlara özel şifreler konuldu. Yazılımlar güncellendi. Belgelerin imha makinesine konulması yerine yakılarak imha yöntemine geçildi. Tüm fotokopi cihazları özel yetkili bir personele zimmetlendi. Bilgisayar çıktıları ve gizli belgelerin her biri özel olarak numaralandırıldı.
