Cumhurbaşkanı Gül'ün askere sivil yargı yolunu açan yasayı, "Ek düzenleme isteyerek" onaylaması CHP'de tepkiye yol açtı. CHP Genel Başkanı Deniz Baykal'ın ilk duyduğunda "Beklenen oldu" diye tepki verdiği öğrenildi. CHP, düzenlemenin iptali için Anayasa Mahkemesi'ne başvuracak. Baykal, Gül'ün yasayı onayladığı haberini MYK toplantısı sonrası Genel Merkez'den ayrıldığı dakikalarda öğrendi. Kendisine onay haberini vermek için telefon eden kurmayına önce, "Onayladı mı?" diye sordu, "Evet" yanıtını alınca da, "Ek düzenleme istedi mi?" diyerek sonucu tahmin ettiğini hissettirdi. Baykal'ın, "Tarafsız cumhurbaşkanı olduğunu yine gösteremedi. Böylece beklenen oldu" demekle yetindiği bildirildi. CHP Genel Başkan Yardımcısı Öymen'in tepkisi ise daha ağır oldu. Öymen şunları söyledi: "Sivillerin sivil mahkemelerde yargılanmasına kimsenin bir diyeceği yoktur. Ancak askerlerin askeri mahkemelerde yargılanmasının kısıtlanmasıyla ilgili AİHM'de verilmiş bir karar bulunmuyor. Cumhurbaşkanı'nın Anayasa'ya sadakat yemininin arkasında durarak açık ve net bir tavır sergilemesini bekliyorduk. Ama böyle yapmadı. Tarafsız olduğunu gösterme fırsatını kaçırdı ve taraflı davrandı. Biz düzenlemenin iptali için Anayasa Mahkemesi'ne götüreceğiz."
