Beşiktaş formasıyla ilk kez 2003-04'te tanışan; dört maçta
(2 kupa, 2 lig) oynayan Gökhan Zan, o sezonun sonunda G.Antep'e kiralık gönderildi. Antep'te 28 lig maçında forma giyerek istikrarlı bir çizgi yakalayan Gökhan, sezon sonu yuvasına döndü. Siyah-beyazlı forma ile lig ve kupada 14 maça çıktığı 2005-06'da ilk defa A Milli Takım formasını giydi. Dört sezondur Beşiktaş'a hizmet eden ve talihsiz sakatlıkları sonucu,
'cam adam' olarak anılan Gökhan Zan, Beşiktaş forması ile 5 sezonda
(İlk sezonu da dahil) Türkiye'de tam 96 maça çıktı; dört de gol attı. Avrupa'da 13 maçta oynayan Zan, siyahbeyazlı forma ile 109 maçta mücadele etti. Hatay, Dardanel, G.Antep ve Beşiktaş formalarını giyen Gökhan'ın kariyerinde 42 sarı, 3 de kırmızı kart var. Geçen sezon 22. haftada İstanbul BŞB kalesini sarsan ve 7.haftada takımın başına geçen Mustafa Denizli'nin verdiği şansları iyi değerlendirdi. Özellikle kaptanlık bandını da taktığı son haftalarda Denizli'nin vazgeçilmezi oldu.